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          目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序服務(wù)

          更新時(shí)間:2019-02-19點(diǎn)擊次數(shù):2615

          目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序介紹

          目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序是一種高度特異和靶向的方法,是指采用各種技術(shù)手段將待檢測(cè)的目標(biāo)區(qū)域富集之后,進(jìn)行高通量測(cè)序的研究策略。目標(biāo)區(qū)域的高深度測(cè)序可以有效識(shí)別基因的變異并對(duì)其進(jìn)行特征譜分析,通常用于分析特定基因組區(qū)域中的DNA變異,尤其是腫瘤的基因組研究。

          目標(biāo)區(qū)域高通量測(cè)序的策略與區(qū)別

           

          液相雜交捕獲

          擴(kuò)增子測(cè)序

          富集策略

          探針雜交

          多重PCR

          適用范圍

          100k<目標(biāo)區(qū)域<100M

          目標(biāo)區(qū)域<100k

          檢測(cè)變異類型

          SNP、大片段Indels、融合基因、基因擴(kuò)增等。

          SNP、小片段Indels、基因擴(kuò)增等

          核酸起始量

          100-200ng

          50-100ng

          優(yōu)勢(shì)

          發(fā)現(xiàn)新的SNP、融合基因、大片段Indels等

          常用于發(fā)現(xiàn)低頻突變(低于0.1%),可用于ctDNA的研究

          制約因素

          探針捕獲效率

          panel擴(kuò)增均一性

          擴(kuò)增子測(cè)序
          原理:通過(guò)設(shè)計(jì)目標(biāo)基因組區(qū)域的引物,經(jīng)多重PCR反應(yīng)擴(kuò)增將目標(biāo)區(qū)域DNA富集純化后,進(jìn)行高通量測(cè)序和數(shù)據(jù)分析。通常用于擴(kuò)增區(qū)域較小(<100k)的情況。

          技術(shù)流程

          技術(shù)優(yōu)勢(shì)

          目標(biāo)區(qū)域小,測(cè)序成本較低,測(cè)序深度通常可高達(dá)10000X(常規(guī)全外顯子組測(cè)序?yàn)?00X),因此可以發(fā)現(xiàn)低頻的突變。

          可選panel:包括現(xiàn)成產(chǎn)品(適合不同腫瘤的基因組合)和個(gè)性化定制兩種

          Panel類型

          50 gene

          BRCA1/2

          定制

          適用腫瘤

          所有腫瘤

          乳腺癌

          覆蓋基因組

           

          覆蓋區(qū)域

          熱點(diǎn)突變區(qū)

          全外顯子區(qū)

          擴(kuò)增子數(shù)目

          207

          148

          Panel大小

          40K

          17K

           

          panel名稱

          適合腫瘤

          適用樣本

          應(yīng)用

          50 gene panel

          (可定制)

          所有腫瘤

          FFPE

          從腫瘤組織切片中檢出腫瘤特異性低頻突變,可以應(yīng)用于腫瘤患者的靶向用藥指導(dǎo)、晚期患者的監(jiān)測(cè)、個(gè)體化治療的療效評(píng)估等。

          血漿(ctDNA)

          從ctDNA檢出腫瘤特異性低頻突變,可以應(yīng)用于腫瘤的超早期篩查、腫瘤患者的靶向用藥指導(dǎo)、晚期患者的監(jiān)測(cè)、個(gè)體化治療的療效評(píng)估等。

          BRCA1/2 panel

          乳腺癌

          全血

          檢測(cè)乳腺癌BRCA1/2易感基因上存在的致癌熱點(diǎn)突變。

           

          樣品要求
          1、樣品純度要求:OD值應(yīng)在1.82.0之間;電泳檢測(cè)無(wú)明顯非特異性雜帶,PCR產(chǎn)物條帶清晰、完整。
          2、樣品濃度:純化后PCR產(chǎn)物濃度不低于5 ng/ul。
          3、樣品總量:樣品總量不低于200ng。
          4、樣品信息:請(qǐng)?zhí)峁〥NA樣品具體濃度、體積、制備時(shí)間、溶劑名稱及物種來(lái)源。請(qǐng)同時(shí)附上QC數(shù)據(jù),包括電泳膠圖、分光光度或Nanodrop儀器檢測(cè)數(shù)據(jù)。
          服務(wù)流程
          1、提交項(xiàng)目課題相關(guān)需求和資料。
          2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)討論項(xiàng)目細(xì)節(jié)。
          3、根據(jù)討論后的意見(jiàn)對(duì)實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行修改。
          4、雙方均滿意并達(dá)成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
          5、開(kāi)展實(shí)驗(yàn),按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。
          6、結(jié)題,提供實(shí)驗(yàn)原始結(jié)果和分析結(jié)果、實(shí)驗(yàn)流程、實(shí)驗(yàn)條件等等。
          我們的優(yōu)勢(shì)
          1、游離DNA純化技術(shù)能有效去除基因組DNA污染,使定量更準(zhǔn)確。
          2、擴(kuò)增子生成技術(shù)提高了擴(kuò)增子生成的均一性,降低測(cè)序成本。
          3、低頻突變生物分析技術(shù)能有效在背景中檢出相關(guān)低頻突變。
          4、為了克服PCR擴(kuò)增中引入的人源誤差,在進(jìn)行任何擴(kuò)增之前加入U(xiǎn)MIs(unique molecular indices),從而保留起始DNA分子的wei一性并克服PCR擴(kuò)增帶來(lái)的假陽(yáng)性問(wèn)題,以及文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中引入的偏差。
          咨詢與訂購(gòu) 
          感謝您選擇我們的服務(wù),如果您有任何問(wèn)題,請(qǐng)聯(lián)系我們,我們將竭誠(chéng)為您解答和服務(wù)。 
           

           

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