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          siRNA轉(zhuǎn)染標(biāo)準(zhǔn)操作流程

          更新時(shí)間:2025-07-16點(diǎn)擊次數(shù):57

          以下是經(jīng)過(guò)優(yōu)化的 siRNA轉(zhuǎn)染標(biāo)準(zhǔn)操作流程,整合了關(guān)鍵參數(shù)優(yōu)化與避坑指南,適用于絕大多數(shù)哺乳動(dòng)物細(xì)胞系(貼壁/懸浮),分為 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、操作步驟、質(zhì)控要點(diǎn)三部分:

          一、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)關(guān)鍵點(diǎn)(轉(zhuǎn)染前必看)

          要素

          推薦方案

          避坑提示

          siRNA濃度

          終濃度10-50nM(預(yù)實(shí)驗(yàn)梯度測(cè)試)

          100nM易致脫靶效應(yīng)

          細(xì)胞密度

          貼壁細(xì)胞:30-50%匯合度
          懸浮細(xì)胞:2-5×10?/mL

          過(guò)密毒性;過(guò)低效率

          轉(zhuǎn)染試劑

          Lipofectamine™ RNAiMAX(通用)
          jetPRIME®(原代/難轉(zhuǎn)細(xì)胞)

          避免含血清培養(yǎng)基稀釋試劑

          對(duì)照設(shè)置

          - 陰性對(duì)照:Scrambled siRNA
          - 陽(yáng)性對(duì)照:GAPDH siRNA
          - 空白對(duì)照:僅轉(zhuǎn)染試劑

          缺一不可!












          二、標(biāo)準(zhǔn)操作流程(以24孔板為例)

           Day 0:細(xì)胞鋪板

          1. 消化細(xì)胞 用wanquan培養(yǎng)基 調(diào)整密度 每孔接種 0.5mL(貼壁細(xì)胞數(shù):5-8×10?;懸浮細(xì)胞數(shù):2×10?)  

          2. 37℃培養(yǎng)箱放置 16-24h(目標(biāo):轉(zhuǎn)染時(shí)匯合度≈40%)  

          關(guān)鍵細(xì)節(jié):  

          - siRNA工作液濃度 = 儲(chǔ)存濃度×30(例:20μM儲(chǔ)存液工作液終濃度≈33nM)  

          - 轉(zhuǎn)染試劑用量參考說(shuō)明書(shū)(RNAiMAX通常 試劑:siRNA體積比=1:1)  

           Day 2:換液與檢測(cè)  

          1. 轉(zhuǎn)染后 6h 更換wanquan培養(yǎng)基(高毒性細(xì)胞如原代神經(jīng)元需4h內(nèi)換液)  

          2. 繼續(xù)培養(yǎng) 24-72h(基因沉默峰值時(shí)間需預(yù)實(shí)驗(yàn)確定)  

           三、質(zhì)控關(guān)鍵步驟(決定成敗!)

           1. 轉(zhuǎn)染效率驗(yàn)證(必做)

          - 方案1:轉(zhuǎn)染 FAM標(biāo)記siRNA → 24h后熒光顯微鏡觀察(效率>80%合格)  

          - 方案2:共轉(zhuǎn)染 EGFP質(zhì)粒 計(jì)算綠色細(xì)胞占比(成本低但間接)  

           2. 沉默效果檢測(cè)

           3. 細(xì)胞毒性評(píng)估

          - MTT法:轉(zhuǎn)染后24h檢測(cè),存活率應(yīng)>85%  

          - 形態(tài)觀察:懸浮細(xì)胞聚團(tuán)、貼壁細(xì)胞空泡化提示毒性過(guò)強(qiáng)  

           四、高頻問(wèn)題解決方案

          問(wèn)題

          原因

          優(yōu)化方案

          效率低

          siRNA降解/試劑失效

          新解凍siRNA;更換轉(zhuǎn)染試劑批次

          細(xì)胞死亡率高

          復(fù)合物局部濃度過(guò)高

          轉(zhuǎn)染前混勻培養(yǎng)基;懸浮細(xì)胞用旋轉(zhuǎn)培養(yǎng)法

          沉默效果不穩(wěn)定

          基因半衰期長(zhǎng)

          延長(zhǎng)檢測(cè)至72h;轉(zhuǎn)染兩次(間隔24h

          脫靶效應(yīng)

          siRNA種子區(qū)匹配非靶基因

          更換siRNA序列;使用化學(xué)修飾siRNA(如Stealth™

          五、特殊細(xì)胞優(yōu)化方案

          1. 原代細(xì)胞:  

             - 轉(zhuǎn)染試劑:選 DharmaFECT™ Primary jetPRIME®  

             - 方案:轉(zhuǎn)染前饑餓處理2h(無(wú)血清培養(yǎng)基)復(fù)合物孵育時(shí)間縮短至5min  

          2. 懸浮細(xì)胞:  

             - 試劑:Neofect™ DNA/RNA Transfection Reagent  

             - 步驟:離心收集細(xì)胞 重懸于復(fù)合物 → 24孔板每孔接種500μL(密度5×10?/mL)  

          3. 難轉(zhuǎn)細(xì)胞(如神經(jīng)元):  

             - 專(zhuān)用試劑:NeuroFect™(佐劑提高穿透性)  

             - 轉(zhuǎn)染后不換液 直接補(bǔ)等體積wanquan培養(yǎng)基  

          六、試劑耗材推薦表

          類(lèi)型

          推薦產(chǎn)品

          適用場(chǎng)景

          通用轉(zhuǎn)染試劑

          Lipofectamine™ RNAiMAX

          293T/HeLa等常見(jiàn)細(xì)胞

          難轉(zhuǎn)細(xì)胞試劑

          jetPRIME®

          原代/干細(xì)胞/懸浮細(xì)胞

          陽(yáng)性對(duì)照siRNA

          Silencer™ GAPDH siRNA

          體系驗(yàn)證

          陰性對(duì)照

          AllStars Neg. siRNA

          排除非特異效應(yīng)

          > 數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn):合格實(shí)驗(yàn)需滿(mǎn)足——轉(zhuǎn)染效率>80% + 沉默效率>70% + 細(xì)胞存活>85%

          避雷總結(jié):  

          1. 勿用含抗生素或血清的培養(yǎng)基稀釋復(fù)合物(滅活試劑)  

          2. 轉(zhuǎn)染后換液時(shí)間寧早勿晚(超8h毒性飆升)  

          3. 凍存siRNA避免反復(fù)凍融>3次(分裝儲(chǔ)存-80℃)  

          按照此流程操作,可穩(wěn)定獲得可重復(fù)的基因沉默數(shù)據(jù)!

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